颁发营养师证的部门主要是国家卫生健康委员会(原卫生部)和人力资源和社会保障部，这两个部门共同负责营养师职业资格的认证和管理。

国家卫生健康委员会(原卫生部)作为国务院组成部门之一，负责制定和实施卫生健康政策、法规和标准，以及对医疗卫生行业进行监管，在营养师职业资格认证方面，国家卫生健康委员会会组织专家对申请人进行严格的审核，确保申请人具备相应的专业知识和技能，通过考试并获得合格成绩后，申请人可以向国家卫生健康委员会申请颁发营养师资格证书。

人力资源和社会保障部负责全国范围内的职业资格证书管理，包括营养师证书的发放，在申请人通过国家卫生健康委员会的审核后，人力资源和社会保障部会根据相关政策和规定，为申请人颁发营养师证书。

各省、自治区、直辖市也设有卫生健康委员会或人力资源社会保障厅，负责本辖区内的营养师职业资格认证工作，在这些地区，申请人需要先向所在地的卫生健康委员会或人力资源社会保障厅提交相关材料，经过初审和复审后，参加地方组织的营养师考试，考试合格并获得成绩后，申请人可以向当地的卫生健康委员会或人力资源社会保障厅申请颁发营养师证书。

营养师证书的颁发涉及多个部门，包括国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部以及各省、自治区、直辖市的卫生健康委员会或人力资源社会保障厅，申请人需要遵循相关政策和程序，通过严格的考核，才能获得营养师证书。