如果您的高级文秘及办公自动化证书纸质版不见了，您可以采取以下措施：

1、不要慌张，请保持冷静，因为这种情况是可以解决的。

2、尽快联系颁发证书的机构或学校，告诉他们您的情况，询问他们是否可以为您提供一份电子版证书或者重新发放一份纸质版证书，大多数机构和学校都会理解您的处境，并尽力帮助您解决问题。

3、如果机构或学校无法提供电子版证书或重新发放纸质版证书，您可以尝试联系当地的公证处或律师事务所，他们可能会为您提供一些关于如何补办证书的建议或者帮助您起草一份声明，证明您确实拥有这个证书。

4、在寻求帮助的过程中，请确保您提供的所有信息都是准确无误的，这包括您的姓名、身份证号、证书编号等，这些信息将有助于机构或学校更快地找到您的证书记录。

5、如果以上方法都无法解决问题，您可以考虑向当地消费者权益保护部门投诉，他们可能会对您的情况进行调查，并协助您解决问题。

6、为了避免类似的问题再次发生，建议您妥善保管好自己的证书和其他重要文件，可以将它们存放在一个安全的地方，如保险箱或文件柜，以防止丢失或损坏。

虽然高级文秘及办公自动化证书纸质版不见了可能会给您带来一些麻烦，但只要您采取正确的措施，通常都可以找到解决方案，希望以上建议对您有所帮助。