中医针灸师证办理机构是指负责为中医针灸师提供专业培训、考试和证书颁发的机构，中医针灸师证的办理主要由以下几类单位进行：

1、国家卫生健康委员会（National Health Commission，简称NHC）：作为中国国家级卫生行政部门，国家卫生健康委员会负责制定和实施中医药行业的政策法规，对中医针灸师证的办理工作进行监督和管理。

2、国家中医药管理局（State Administration of Traditional Chinese Medicine，简称SATCM）：国家中医药管理局是国务院直属事业单位，主要负责中医药事业的管理工作，在中医针灸师证的办理方面，国家中医药管理局主要负责制定相关政策、标准和规范，指导和监督各级中医药管理部门的工作。

3、省级卫生健康委员会（Health Commission of Provinces）：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会是地方卫生行政部门，负责本行政区域内的中医药工作，在中医针灸师证的办理方面，省级卫生健康委员会主要负责组织实施本地区的培训、考试和证书颁发工作。

4、中医药行业协会和学会：中医药行业协会和学会是中医药行业的专业组织，负责推动中医药事业的发展，在中医针灸师证的办理方面，中医药行业协会和学会主要负责开展专业培训、技术交流和学术研究等工作。

5、中医药高等院校和职业培训机构：中医药高等院校和职业培训机构是培养中医针灸师的重要基地，在中医针灸师证的办理方面，这些机构主要负责开展中医针灸师的专业培训、实践教学和技能考核等工作。

6、中医药科研机构：中医药科研机构主要从事中医药领域的科学研究和技术推广工作，在中医针灸师证的办理方面，中医药科研机构主要负责开展中医针灸师的科研培训、技术指导和成果推广等工作。

7、中西医结合医疗机构：中西医结合医疗机构是中医药与西医药相结合的新型医疗机构，在中医针灸师证的办理方面，中西医结合医疗机构主要负责开展中医针灸师的实践培训、临床指导和技能提升等工作。

8、中医药企业：中医药企业主要从事中医药产品的研发、生产和销售工作，在中医针灸师证的办理方面，中医药企业主要负责开展中医针灸师的职业培训、技能提升和人才选拔等工作。

中医针灸师证的办理涉及多个部门和单位，包括国家卫生健康委员会、国家中医药管理局、省级卫生健康委员会、中医药行业协会和学会、中医药高等院校和职业培训机构、中医药科研机构、中西医结合医疗机构和中医药企业等，这些单位共同承担着中医针灸师的培养、培训、考试和证书颁发等工作，为中医针灸师队伍的建设和发展提供了有力保障。