中医针灸师证的颁发部门有很多，其中比较权威的有国家中医药管理局、中国中医科学院、中华中医药学会等，这些部门都是经过国家相关部门批准设立的，具有一定的权威性和专业性。

国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属事业单位，负责全国中医药事业的管理和监督工作，该局下设多个部门，包括针灸科、推拿科等，其中针灸科主要负责中医药行业的标准化、规范化和信息化工作，对于中医针灸师证的颁发具有一定的权威性。

中国中医科学院是中国最高学术机构和全国中医药科学研究中心，也是国家中医药管理局机关的直属单位，该院拥有众多知名的中医专家和学者，对于中医针灸师证的颁发也具有一定的权威性。

中华中医药学会是一个全国性的社会团体组织，旨在推动中医药事业的发展和交流，该学会下设多个专业委员会，包括针灸专业委员会等，对于中医针灸师证的颁发也具有一定的权威性。

无论选择哪个部门颁发的中医针灸师证，都需要具备相应的专业知识和技能才能获得认可，在选择培训机构时也需要谨慎选择，以确保所获得的证书具有权威性和可信度。