中医康复理疗师证是一门专业的技能证书，主要针对中医康复理疗领域的从业人员，在选择哪个部门的中医康复理疗师证时，需要考虑以下几个方面：

1、行业认可度：我们需要了解不同部门颁发的中医康复理疗师证在行业内的认可度，国家卫生健康委员会、国家中医药管理局等政府部门颁发的证书具有较高的权威性和认可度，一些行业协会和专业机构也会颁发相关的证书，这些证书同样具有一定的权威性，在选择哪个部门的中医康复理疗师证时，可以优先考虑政府部门和行业协会颁发的证书。

2、培训质量：我们需要关注各个部门提供的中医康复理疗师培训课程的质量，优质的培训课程可以帮助学员更好地掌握中医康复理疗的理论知识和实践技能，从而提高自身的专业素养，在选择培训课程时，可以参考学员评价、师资力量、教学设施等方面的信息，以确保所选课程能够满足自己的学习需求。

3、就业前景：我们还需要关注各个部门颁发的中医康复理疗师证对就业的影响，具备较高权威性和认可度的证书更容易获得用人单位的青睐，从而提高就业竞争力，在选择哪个部门的中医康复理疗师证时，可以考虑该证书对个人职业发展的影响。

4、考试难度：我们需要关注各个部门颁发的中医康复理疗师证的考试难度，考试难度较低的证书更容易通过，从而节省时间和精力，过于简单的证书可能无法充分检验学员的专业能力，因此在选择考试难度适中的证书时，需要权衡各种因素。

选择哪个部门的中医康复理疗师证需要综合考虑行业认可度、培训质量、就业前景和考试难度等多个方面，在实际操作中，可以根据自己的兴趣爱好、职业发展规划以及所在地区的行业需求来做出合适的选择，建议在选择证书时，不妨咨询相关行业的专家和前辈，以获取更多的意见和建议。