在填写国际商务单证员证书颁发机构时，需要根据实际情况选择合适的机构，国际商务单证员证书颁发机构主要包括以下几种：

1、各国政府主管部门：例如我国的商务部、外交部等，这些部门会负责颁发和管理国际商务单证员证书，在申请证书时，需要向这些部门提交相关材料，经过审核后，由这些部门颁发证书。

2、行业协会和专业机构：例如中国国际商会、中国国际贸易促进委员会等，这些协会和机构会组织培训和考试，对合格者颁发国际商务单证员证书，在申请证书时，需要参加协会或机构组织的培训课程，并通过考试，然后由协会或机构颁发证书。

3、高校和培训机构：一些高校和培训机构也会开设国际商务单证员专业课程，对合格者颁发证书，在申请证书时，需要参加这些机构的培训课程，并通过考试，然后由机构颁发证书。

4、企业内部培训和认证：一些大型企业会设立专门的部门或岗位，负责国际商务单证员的培训和认证工作，在企业内部完成培训和考核后，员工可以获得企业颁发的国际商务单证员证书。

5、其他专业认证机构：除了上述几种主要的颁发机构外，还有一些专门从事国际商务单证员认证的专业认证机构，在申请证书时，可以选择这些机构进行认证。

在选择国际商务单证员证书颁发机构时，需要考虑以下几个因素：

1、机构的权威性：选择具有较高权威性的机构颁发的证书，可以提高个人职业素质和竞争力。

2、培训机构的质量：选择教学质量较高的培训机构，可以确保自己能够学到实用的知识和技能。

3、培训机构的口碑：可以通过网络搜索、咨询同行等方式了解培训机构的口碑，选择评价较好的机构。

4、培训机构的价格：根据自己的经济状况，选择价格合理的培训机构。

5、培训机构所在地：如果需要参加线下培训课程，可以考虑选择地理位置方便的培训机构。

在填写国际商务单证员证书颁发机构时，需要综合考虑各种因素，选择适合自己的颁发机构，获得证书后，还需要不断学习和实践，提高自己的业务能力，以适应国际商务发展的需要。