针灸师证和针灸门诊证是两个不同的概念，针灸师证是指通过国家中医药管理局组织的中医针灸师资格考试获得的证书，证明持有人具备从事中医针灸工作的资格，而针灸门诊证是指在医疗机构开设针灸诊疗服务所需的执业许可证，需要向当地卫生行政部门申请办理。

如果您想在医疗机构开设针灸门诊，需要先获得针灸门诊证，具体办理流程如下：

1、准备材料：包括身份证、学历证明、医师资格证书、针灸师证书等。

2、选择合适的医疗机构：根据自己的实际情况，选择一家符合规定的医疗机构。

3、提交申请：将准备好的材料提交给当地卫生行政部门，填写相关信息并缴纳相关费用。

4、审核和培训：卫生行政部门会对申请人提交的材料进行审核，审核通过后会组织相关培训。

5、领取证书：完成培训后，到卫生行政部门领取针灸门诊证。

需要注意的是，不同地区的办理流程可能会有所不同，具体以当地卫生行政部门的要求为准，开设针灸门诊还需要遵守相关的法律法规和卫生标准，确保医疗服务的质量和安全。