在回答这个问题之前，首先我们需要了解办公自动化证书和计算机二级证书的含义。

办公自动化证书通常指的是微软办公软件认证(Microsoft Office Specialist),这是一种证明你对Microsoft Office套件中特定应用程序(如Word,Excel,Aess,Outlook等)具有高级技能的证书，这种证书主要侧重于使用Office软件进行日常业务操作的能力。

计算机二级证书则是由中国国家教育部颁发的一种计算机应用能力证书，证明持有者具备一定的计算机应用基础知识和技能，这种证书涵盖了计算机硬件、操作系统、网络技术、数据库管理等多个方面的知识。

从理论上讲，这两种证书并不冲突，你可以同时拥有这两种证书，因为它们分别代表了不同的技能和知识领域，在实际应用中，是否需要同时持有这两种证书可能取决于你的具体工作需求和职业规划。

如果你的工作主要涉及到使用Microsoft Office软件进行日常办公活动，那么Microsoft Office Specialist可能更适合你，而如果你的工作需要处理复杂的计算机系统或进行数据库管理等工作，那么计算机二级证书可能更有帮助。

办公自动化证书和计算机二级证书并不冲突，但你需要根据自己的具体需求来选择适合自己的证书，这两种证书都可以提高你的职业技能，增加就业竞争力，所以考虑获取这两种证书是一个很好的选择。