针灸师证是由中国国家卫生健康委员会颁发的，是国家承认的职业资格证书，针灸师证书分为三个等级：初级、中级和高级，高级针灸师证书是由国家中医药管理局颁发的，是目前最高级别的针灸师证书。

至于中科院发的针灸师证是否卫生部门认可，我无法确定，根据我所查到的信息，目前国家卫生健康委员会颁发的针灸师证书是最权威的，如果您想成为一名合格的针灸师，建议您考取国家卫生健康委员会颁发的针灸师证书。

希望这些信息能够帮到您，如果您有其他问题，请随时问我。