针灸师证的发放机构有很多，其中比较权威的有国家中医药管理局、各省市中医药管理局、中医药大学等，这些机构都是经过国家批准设立的，具有一定的资质和实力，可以为学员提供专业的培训和考核服务。

国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属的部门，负责全国中医药事业的管理和监督工作，该局设有专门的针灸师培训中心，负责组织和实施全国范围内的针灸师培训和考核工作，在这里获得的针灸师证书具有很高的权威性和认可度。

各省市中医药管理局也是负责本地区中医药事业管理和监督工作的部门，其下设有相应的培训机构和考核机构，学员可以在本地区的中医药管理局指定的培训机构接受培训，并通过考核获得针灸师证书，这种方式的优点是可以更好地适应当地的实际情况和需求，但是相对来说权威性和认可度可能会稍低一些。

中医药大学则是专门从事中医药教育和研究的高等院校，其下的针灸学院或医学院通常会开设针灸师培训班，在这些学校获得的针灸师证书通常具有更高的权威性和认可度，因为它们拥有更为丰富的教学经验和资源，并且注重理论与实践相结合。

选择哪种机构颁发针灸师证书主要取决于个人的需求和实际情况，如果想要获得更高权威性和认可度的证书，建议选择国家中医药管理局或中医药大学；如果想要更好地适应当地的实际情况和需求，可以选择各省市中医药管理局指定的培训机构，无论选择哪种方式，都需要认真选择合适的培训机构和老师，确保自己能够获得专业、全面、系统的培训和指导。