针灸师证和针灸门诊证是两个不同的概念，针灸师证是指通过国家中医药管理局组织的针灸师资格考试合格后颁发的证书，是从事针灸工作的必备证件，而针灸门诊证是指在医疗机构开设针灸门诊时，需要向当地卫生行政部门申请办理的执业许可证书。

根据《中华人民共和国医师法》和《中华人民共和国护士法》的规定，只有取得相应的医师资格或者护士资格的人员才能够开设医疗机构并从事相应的医疗活动，如果您想在医疗机构开设针灸门诊，您需要先取得相关的医师资格或者护士资格，然后再向当地卫生行政部门申请办理针灸门诊证。

需要注意的是，不同地区对于针灸师证和针灸门诊证的办理要求可能会有所不同，建议您咨询当地的卫生行政部门或者相关行业协会了解具体的办理流程和要求。