中医针灸师证办理机构主要负责对申请者进行资格审查、培训和考核，以确保其具备从事中医针灸工作的能力和水平，有多个单位和部门负责中医针灸师证的审批工作，主要包括以下几个方面：

1、卫生健康委员会：卫生健康委员会是负责中医药事业管理和监督的部门，其下属的中国中医科学院、国家中医药管理局等机构负责中医针灸师证的审批工作。

2、人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部负责职业资格证书的颁发和管理，其下属的职业技能鉴定中心负责中医针灸师证的审批工作。

3、中医药管理部门：各省、自治区、直辖市的中医药管理部门也负责本地区的中医针灸师证审批工作，这些部门通常设有专门的中医药管理处或中医药考试中心，负责组织中医针灸师的培训、考试和证书发放。

4、中医药大学：中医药大学作为中医药教育和科研的重要基地，也承担着中医针灸师证的培训和考核任务，学生在完成学业后，可以向学校申请参加中医针灸师证的考试。

5、其他培训机构：除上述政府部门和高校外，还有一些专门从事中医针灸师培训的机构，如中医针灸技能培训中心、中医针灸职业资格培训学校等，这些机构也参与到中医针灸师证的审批工作中。

6、社会组织和民间团体：一些社会组织和民间团体，如中国针灸学会、中国中医研究院等，也参与到中医针灸师证的审批工作中，为有需要的人员提供培训和考核服务。

中医针灸师证办理机构涉及多个部门和单位，包括政府部门、高校、培训机构、社会组织等，申请者需要根据自己的实际情况选择合适的单位进行报名和培训，通过考核后才能获得中医针灸师证，在办理过程中，申请者需注意查阅相关政策和规定，确保符合审批要求。