营养师证抵扣个税流程是指持有营养师证书的个人在缴纳个人所得税时，可以享受一定的税收优惠政策，具体流程如下：

1、首先要确保自己是合法取得营养师资格证书的，只有通过国家统一组织的营养师资格考试并获得相应等级证书的人员，才能被认为是合格的营养师，考试通常分为初级、中级和高级三个等级，每个等级都有相应的资格证书。

2、在满足上述条件的情况下，个人需要在每年的3-6月之间，通过中国税务机关网站或现场办理的方式，提交个人所得税纳税申报表，在申报表中，需要对相关收入进行详细填写，并注明是否享受了营养师证书抵扣个税的优惠政策。

3、在提交纳税申报表后，税务机关会对个人的申报信息进行审核，如果符合营养师证书抵扣个税的条件，税务机关会在核定个人应纳税额时，按照规定的标准扣除相应的税款，具体的扣除额度会根据个人所取得的营养师资格证书等级、收入情况等因素来确定。

4、个人需要在规定的时间内，到指定的银行网点或网上银行进行缴税，缴税成功后，税务机关会出具税收征收证明，作为享受营养师证书抵扣个税政策的有效凭证。

需要注意的是，营养师证书抵扣个税的具体政策可能会随着国家政策的变化而调整，在进行申报时，建议参考最新的税收政策规定，以确保自己的申报符合相关规定，如果对税收政策有疑问，可以咨询专业的税务师或拨打税务服务热线进行咨询。