针灸师证书的发放和认证是确保针灸师具备专业技能和知识的重要环节，针灸师证书的发放主要由以下几个部门负责：

1、人力资源和社会保障部(原劳动和社会保障部):负责制定和管理针灸师职业技能鉴定标准，对参加针灸师职业技能鉴定的人员进行考核和评价，发放针灸师职业技能鉴定证书。

2、国家中医药管理局：负责中医药行业的管理和监督，对针灸师的职业资格进行认定，发放针灸师执业证书。

3、各省、自治区、直辖市中医药管理部门：负责本地区中医药行业的管理和监督，对本地针灸师的职业资格进行认定，发放针灸师执业证书。

4、中国中医科学院、中国中医研究院等科研机构：负责针灸师的专业培训和教育，对学员进行考核和评价，发放针灸师培训证书。

5、各地中医院校：作为针灸师培训的主要场所，负责培养针灸师人才，对学员进行考核和评价，发放针灸师毕业证书。

6、各地中医药培训机构：为针灸师提供专业的培训课程和辅导服务，对学员进行考核和评价，发放培训证书。

7、一些行业协会和专业组织：如中国针灸学会、中国民间中医医药研究开发协会等，负责组织和推广针灸师的培训和认证工作，发放相关证书。

8、一些国际组织和认证机构：如世界卫生组织(WHO)等，对于具有国际影响力的针灸师，可以提供国际认可的证书和资格。

想要获得有效的针灸师证书，需要在以上相关部门和机构中选择合适的途径进行培训、考试和认证，针灸师在实际工作中还需要不断学习和提高自己的专业技能，以满足社会对针灸服务的需求。