中医康复理疗师证书的含金量高低，主要取决于颁发机构的权威性和专业性，有多个机构可以颁发中医康复理疗师证书，如中国中医药管理局、各省市中医药管理局、中医药大学等，中国中医药管理局颁发的证书最具权威性，因为它是国家级的卫生健康行政部门，具有最高的行政权力。

一些知名的中医药大学也具有较高的含金量，北京中医药大学、上海中医药大学、广州中医药大学等都是国内知名的中医药大学，其颁发的证书在业界具有较高的认可度。

选择哪个机构颁发的中医康复理疗师证书，需要根据自己的实际情况和需求来决定，如果想要在大型医院或康复中心工作，那么最好选择中国中医药管理局或知名中医药大学颁发的证书；如果想要自己创业或者开设私人诊所，那么可以选择各省市中医药管理局颁发的证书。